Ya unas cuantas publicaciones te mostramos como hacer para renombrar archivos desde la consola de nuestro linux, pero a veces es más fácil una aplicación gráfica.
Gprename una pequeña herramienta que simplifica el tener que modificar gran cantidad de nombres de archivos, simple de instalar y usar:
$ sudo aptitude install gprename
Una vez instalado podemos correrlo de Aplicaciones > Accesorios > Gprename
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Saludos